合并两家公司可以为公司提供协同效应和规模经济，从而提高效率和盈利能力，但重要的是要注意合并也会产生不利影响。合并后的组织可能更难以合作和沟通，而且市场份额过大的公司可能会消除竞争并提高消费者的价格。
文化冲突
当两家公司合并时，它不仅仅是两个品牌或品牌的合并 - 它是带来特定企业文化的人的真正合并。如果两家公司的企业文化差异很大，就会产生冲突。例如，如果一个具有扁平等级的创新型企业公司要与高度等级化，保守且传统的组织合并，那么新组织中的员工可能难以合作。
规模不经济
当企业合并时，通常会实现规模经济。较大的组织通常能够比小型企业更有效地生产商品和服务，并且每单位成本更低，因为固定成本分散在更多的单位上。然而，情况并非总是如此。有时，当两家公司合并时，规模越大，实际上就会产生规模经济，因为协调成本增加，单位生产成本会增加。
消费者认知
当两家公司合并时，他们需要考虑消费者如何看待这两家公司，以及他们是否以兼容的方式看待它们。例如，如果一家环保肥皂公司与一家环境记录不佳的工业洗涤剂制造商合并，可能会疏远那些不想支持对环境负责的公司的环保肥皂公司的客户。
裁员困境
合并两个企业往往是减少两个组织劳动力的好方法。例如，公司可以将其两个办事处合二为一，减少执行相同职责的人员数量。虽然这可以为公司节省成本，但也可能对员工产生负面影响。员工可能会害怕失去工作，并可能失去对组织的信任。这会降低员工的积极性并降低生产力。
消费者价格上涨
价格竞争在很多情况下反映了竞争。垄断是公司合并的一个巨大潜在问题。即使没有行业内的垄断创造，较少的竞争往往会导致消费者的定价增加。虽然一些增加反映了不经济所涉及的成本增加，但最终结果会使商品和服务的购买者产生不满。企业合并通常必须平衡增加的定价和潜在的裁员，以防止高昂的消费者成本。
