双层工资制度构成了雇员薪资计划，其中高级工人比新工人赚更多的钱。这些支付方案通常存在于工会领域，这些工会协商每个级别的员工的工资率。雇主实施双层工资制度以节省资金并获得竞争优势，尽管他们经常面临系统问题。该系统的负面影响包括员工的不满和与工会的冲突。
不等式
双层工资制度中存在的主要问题之一源于将所有员工平等对待，以促进积极和富有成效的工作场所的经营理念。 “组织与管理与商业沟通”一书的作者桑帕特·慕克吉指出，双层工资制度为两份工人支付两种不同的工资来完成同样的工作。从纯粹的哲学角度来看，这构成了一种不公平的做法，并导致了工作场所的实际问题。
员工不满
双层工资制度中固有的不平等可能导致劳动力的不满。美国联合电气，美国广播电台和机械工人组织（UE），一个代表35,000名工人的全国工会编写的关于双层工资制度的情况介绍报告说，工资低的工人对雇主不满。这种怨恨来自于雇主认为缺乏尊重，因为雇主与同事一起完成同样的工作。 UE情况说明书进一步指出，员工的不满导致了高度的营业额，从长远来看，这可能比维持单层工资制度更昂贵。
员工部门
发表在“时代”杂志上的一篇文章表明，双层工资制度不仅在雇主和雇员之间，而且在雇员之间产生怨恨。文章重点关注联合汽车工人联盟，并指出新工人对高级工人的不满情绪，他们的工资从2010年开始大幅下降。工人的紧张局势导致工作场所不稳定或恶劣，在某些情况下可能会影响生产力。据劳资关系专家汤姆·亚当斯（Tom Adams）称，企业的双层工资制度破坏了团结。
联盟问题
双层工资制度可能会给工会带来问题。就联合汽车工人联盟而言，双层工资制度导致了一种破裂，工会的不同派系组成了自己的团体。工会内部的不满阻碍了集体谈判过程，这可能会阻止所有工人获得公平的补偿，甚至可能导致罢工。此外，一些工会，如UE，建议所有工会不惜一切代价抵制双层工资制度，这意味着实施这种制度的雇主可能面临工人的抵制甚至敌意。
