教会在大多数情况下免于联邦税收 - 如果它符合美国国税局规则下的非营利组织。此外，捐助者将能够就其个人所得税申报表向教会注销捐款。教会仍然可以从与其非营利目的无关的活动中获得收入纳税，并且必须在某些情况下向IRS提交纳税申报表。
免税
要获得教会税收优惠，教会必须具备501（c）（3）非营利组织的资格。如果它也符合IRS规定的教会资格，则无需向美国国税局申请承认其作为非营利组织或等待批准。美国国税局制定了14个标准，教会必须满足这些标准才有资格享受税收优惠。这些包括一个特定的信条，一个教会政府，一个教义的代码，一个既定的礼拜场所和一个常规的会众等。
捐助者
免税地位鼓励人们通过向捐赠者提供税收优惠来向教堂捐款。捐赠给教会的人有权扣除高达调整后总收入50％的金额。由于这会降低应税收入，因此如果捐赠者仔细计划捐赠的数量和时间，也可以将捐赠者降低到较低的税率范围，从而节省净税。虽然教会必须向捐赠者提供价值250美元或以上的捐赠书面确认书（截至2011年1月），但只要捐赠用于宗教目的，他们就不需要为捐款提交纳税申报表。
应税活动
一些创收教会活动是应纳税的。收入是否应纳税取决于其与教会免税目的的关系。如果一个教会挣钱出售宗教文献，即使这笔钱没有捐赠，这笔收入也不征税。然而，如果教会通过举行烘焙销售赚钱，美国国税局可能会质疑烘焙销售是否与宗教活动充分相关，即使收益用于宗教目的。如果教会在纳税年度内从不相关的活动中获得超过1,000美元的收入，则必须提交990-T表并对超过1,000美元的金额（截至2011年1月）纳税。
工资表
如果教会雇用员工，则必须从员工薪水中扣除医疗保险和社会保障税。两个例外情况适用：教会不需要从被任命的牧师的薪水中扣除医疗保险或社会保障，以及因宗教原因而拒绝提供医疗保险和社会保障税的教会可以通过提交8274表格获得豁免。教会必须向员工发放W-2表格并向独立承包商提供1099 MISC表格，以便他们可以提交个人纳税申报表。他们还必须向IRS提交1096表格。
