道德冲突是卧底工作不可避免的一部分。官员经常被要求与他们最终会在法庭上背叛的嫌犯建立友谊和关系。不断需要从犯罪角色转变为军官的真实身份也可能使家庭关系破裂或紧张。官员可能会发现自己更愿意削减道德角落 - 特别是如果他们看到未来改善就业前景，那么他们可能会更长时间地离开自己。
被背叛的关系
对于卧底人员而言，建筑案件意味着与他们最终会背叛的嫌疑人建立密切的关系。前联邦特工比利女王在2005年10月对蒙古摩托车团伙“华盛顿邮报”进行为期两年的调查期间，对这些现实进行了抨击。女王对蒙古人对暴力的偏爱并不抱幻想，尽管他个人很喜欢他们中的许多人。 。报纸称，处理这些相互冲突的情绪的压力最终迫使女王从美国的酒精，烟草，火器和炸药局退休。
腐败风险
最古老的秘密冲突之一是不得不冒犯罪犯而冒犯罪犯。 ABS-CBN网络于2009年2月报道，菲律宾国家警察局局长耶稣维佐萨在禁毒期间禁止使用非法物质表示了这一理由。据报道，警察局长的命令中有221名警察未通过药检。 2008年1月，“纽约时报”称，类似的丑闻震动了纽约南布鲁克林区，四名警察被逮捕，另有六名警察被停职以奖励有毒药物。
身份问题
与家人和朋友隔绝，卧底警察努力平衡他们的真实身份和假设身份。 “华盛顿邮报”指出，女王对蒙古人的工作迫使他的前妻和两个儿子搬迁，他们不知道发生了什么。英国官员也被指控交易性行为以获取信息。法院引用了这些担忧，推翻了科林斯塔格的谋杀罪，“卫报”于2011年1月报道。该裁决随后有报道说，一名卧底警察与斯塔格发起关系以获得供认。
失去诚信
尽管存在风险和压力，秘密工作仍然是寻求长期职业的侦探和警察的一个有吸引力的主张。据“纽约时报”报道，在纽约市卧底可以确保在18个月而不是三到五年内进行侦探推广。这些过程也可能产生一种可能损害机构声誉的切角心态。据“纽约时报”报道，2003年，有30名麻醉品官员从布鲁克林南部被转移出去，涉嫌从该部门加班费30,000美元。
