有限责任公司（LLC）与非营利组织之间的差异主要体现在管理的构成以及任何利润的分配上。一个非营利组织只是意味着任何赚钱的钱都不能在工人之间分享，而是必须重新投入到组织中。
利润
就其性质而言，非营利组织并不是为了赚钱而做生意：它们通常满足社会需求，任何可能赚钱的钱都会被投入到业务中。然而，这并不意味着非营利组织不能赚很多钱 - 它只是意味着所赚的钱必须回到组织中，从而使其增长。然而，有限责任公司可以增长并获利。如果将企业设计为赚钱机会，则最好将其指定为LLC。
控制
控制是LLC与非营利组织的问题。 LLC业务所有者可以以他认为合适的任何合法方式自由经营业务，但非营利组织受其在申请非营利组织状态时所阐述的理论约束。如果非营利组织决定停止运营，其资产必须提供给另一个非营利性协会，而LLC所有者能够保留LLC收集的任何和所有资产。
资金
有限责任公司可以选择为业主筹集资金，但业主希望如此;没有限制。如果有限责任公司需要资金，它可以转到投资者并提供一定比例的未来利润以换取直接资本。非营利组织不能这样做。相反，非营利组织必须依靠资金和慈善捐款。非营利组织也可以从政府和私人补助金中获取资金。
保护
根据现行法律，有限责任公司和非营利组织都可以获得与诉讼相同的保护。换句话说，正如有限责任公司的所有者不能对企业可能发生的债务承担责任一样，董事会和非营利组织的员工也不能承担责任。
雇员
在支付员工薪酬方面，与非营利组织相比，有限责任公司更有利于留住优秀员工。另一方面，由于许多非营利组织是具有社会责任感的组织，因此非营利组织可能能够吸引对非营利组织的整体使命有更大承诺的员工。
