非营利组织必须不断展示其收到的地点，这些资金的去向以及用于慈善工作的百分比。虽然没有关于非营利性审计的官方要求，但大多数组织都要求在其章程中进行审计。年度审计是关闭财政年度的重要组成部分，并表明非营利组织根据组织的使命花费了捐赠的资金。
审计定义
审计审查和验证组织的财务账簿。审计通常与国税局和税收相关联，但非营利组织通过受过培训的会计师或注册会计师进行审计。审计通过支票和存款单核实存款，核实收据和费用报销，并核对银行对账单。审计为非营利组织提供了一种方法，可以保持其支出方法和捐赠使用的透明度。
团队
财务主管将任何非营利组织的账簿与其他董事会成员保持为支票的共同签名人。一些公司要求财务秘书根据指定捐款的方式对所有存款进行分类，然后存入资金。第三人，即审计员，熟悉组织，但可能不参与资金管理。审计师进行实际审计，并要求财务主管和财务秘书提供意见。
收款
对于收入，审计审查程序以确保使用双人系统准确计算现金并将其存入正确的子账户。由于可以为特定目的捐赠或授予资金，因此必须在收到资金后对资金进行分类。
支出
审计员确认费用是合法的。审计员使用会议纪要和批准的预算确认所有花费都得到了适当的授权。审计员审查任何人使用他自己的资金提供的费用收据来购买指定预算的东西。所有收据必须等于董事会批准的报销金额。非营利组织必须制定开放式政策，因此任何人都可以审查费用并提出问题。审计通过验证显示了资金跟踪。
关闭财政年度
要关闭本财年的财务账簿，审计师使用收入和支出记录创建尽可能详细的年度资产负债表。审计员核对银行对账单以确定未完成的支票，并确定尚未到达的额外预期资金。在本财政年度获得但未获得资助的补助金是一个尚未达到账面但属于财政年度的收入的一个例子。
税务审计
当然，美国国税局可以审计一个非营利组织，即使它是免税的。在IRS审核时，它会查找特定项目，例如慈善工作与筹款工作的比例为3：1。这对每个筹款人来说意味着什么，一个组织必须根据其章程任务至少进行三次捐赠活动。
