质量功能部署是一种以客户为导向的方法，用于识别，优先排序并将客户的需求纳入产品制造流程。因为它将最终用户的需求与产品设计和开发的每个方面联系起来，所以QFD也是一个决定功能和产品性能的工具。然而，尽管QFD有用，但它有一些缺点，使其不适合某些企业。
QFD需要正确的组织环境
根据“高级质量功能部署”一书的作者Fiorenzo Franceschini所说，QFD与许多大型企业中的部门或部门组织结构和环境并不相称。这是因为有效的QFD环境需要创新，主动性，团队合作和信息共享。不提供此环境的组织结构通常将QFD流程视为额外的工作，而不是生产满足目标客户需求的产品的方式。为了获得合适的环境，企业可能需要首先进行彻底的重组。
以客户为中心的风险
有效的QFD需要准确的数据分析。虽然调查，焦点小组和民意调查是直接从客户获取信息的方式，但它们并不总能反映客户的真实感受。这可能使得难以在客户需求与产品特征和特征之间建立真正的关系。此外，不正确的分析可能导致获取过多信息，这反过来会导致过长的决策表，使得优先考虑客户需求变得更加困难。
不太适应不断变化的需求
QFD系统和思维方式可以使更加昂贵，困难和复杂的客户需求变化。捕获，记录和将客户需求纳入产品的过程非常耗时，一旦开始生产，就不容易改变。但是，由于客户需求可以快速变化而且几乎没有任何警告，因此QFD有可能将业务留给不符合这些新要求且无法销售的产品。
有限的焦点
QFD专注于企业需要做些什么来满足其客户。一个主要的缺点是它忽略了其他因素，如成本，产品生命周期的长短，长期战略和增长目标以及可用资源。以牺牲这些其他因素为代价过度依赖QFD可能会导致负面的财务和运营后果，从而可能使企业面临风险。
