会计信息系统是为企业用于记录其金融交易而设计的。通过这种类型的系统输入，处理，存储和分发信息。会计信息系统有许多好处;但是，它们也有一些缺点。
学习系统
学习会计信息系统通常很困难且耗时。个人必须接受系统培训，这可能会给公司带来时间和人力方面的不利影响。会计信息系统由许多不同的组件组成，几乎所有系统都是计算机化的。由于它们的复杂性，有些人可能会发现它们难以使用。一个人理解会计系统可能需要数周或数月，而且通常个人仍然不能完全理解系统的能力。如果员工退出组织工作，可能需要数周或数月再次培训其他员工。
信息丢失
会计信息系统通常是计算机化的。因此，总是存在因断电或系统崩溃而丢失信息的风险。发生这种情况时，系统中的所有信息都可能丢失。公司通过定期备份文件并在所有计算机系统上执行标准维护来预防此问题。他们还安装了防病毒软件作为另一项预防措施。但是，这些步骤都没有消除可能发生的潜在问题。会计信息系统存储公司的财务信息多年。如果发生系统崩溃，则会对公司造成重大不利影响。所有或某些信息都会丢失，并且有可能永远无法恢复。
重新评估
公司经常改变他们的经营方式，以跟上最新趋势。为了跟上苛刻的商业世界，这些变化可能会影响会计系统。会计信息系统很难建立，因为每个公司都以自己的方式独特。为了跟上变化，必须经常重新评估会计信息系统。通常需要在系统中进行更改，以便有效地处理信息。这对公司来说可能是一个不利因素，因为重新评估需要时间，而且需要花钱。
